Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms