Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
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