Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK3Q13003 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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