Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms