Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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