Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TP53BP1Q12888 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TP53BP1Q12888 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TP53BP1Q12888 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms