Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TROQ12816 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TROQ12816 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TROQ12816 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TROQ12816 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TROQ12816 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TROQ12816 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TROQ12816 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TROQ12816 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TROQ12816 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TROQ12816 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TROQ12816 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TROQ12816 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TROQ12816 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TROQ12816 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TROQ12816 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TROQ12816 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TROQ12816 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TROQ12816 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TROQ12816 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TROQ12816 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TROQ12816 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TROQ12816 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TROQ12816 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TROQ12816 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TROQ12816 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TROQ12816 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TROQ12816 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TROQ12816 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TROQ12816 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TROQ12816 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TROQ12816 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TROQ12816 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TROQ12816 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TROQ12816 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TROQ12816 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TROQ12816 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TROQ12816 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TROQ12816 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TROQ12816 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TROQ12816 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TROQ12816 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TROQ12816 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TROQ12816 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TROQ12816 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TROQ12816 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TROQ12816 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TROQ12816 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TROQ12816 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TROQ12816 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TROQ12816 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TROQ12816 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TROQ12816 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TROQ12816 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TROQ12816 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TROQ12816 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TROQ12816 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TROQ12816 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TROQ12816 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TROQ12816 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
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