Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 SIW14YNL032W 846 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 DSC3YOR223W 879 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YOR282WYOR282W 321 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YPL067CYPL067C 597 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 RPL43AYPR043W 279 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 NAT3YPR131C 588 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 KEL1YHR158C 3495 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 TMN2YDR107C 2019 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 FHL1YPR104C 2811 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 UBC13YDR092W 462 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 THI5YFL058W 1023 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 LRP1YHR081W 555 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 SPL2YHR136C 447 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YIL029CYIL029C 429 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YVH1YIR026C 1095 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YKL136WYKL136W 399 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 CCW12YLR110C 402 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YLR171WYLR171W 390 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YBL010CYBL010C 843 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YMR254CYMR254C 309 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 POL31YJR006W 1464 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 CWC2YDL209C 1020 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 IZH1YDR492W 951 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 PET54YGR222W 882 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YHR130CYHR130C 336 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 CUE4YML101C 354 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 COX7YMR256C 183 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 LST8YNL006W 912 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 CWC27YPL064C 906 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 COQ1YBR003W 1422 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 RGP1YDR137W 1992 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 GZF3YJL110C 1656 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 TGA1tA(UGC)A 73 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 FIN1YDR130C 876 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 PUG1YER185W 912 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 MIG2YGL209W 1149 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YGR039WYGR039W 312 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 SLX9YGR081C 633 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YPT35YHR105W 645 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YKE4YIL023C 1041 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 GCN3YKR026C 918 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 CHK1YBR274W 1584 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 DSE1YER124C 1722 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YKL075CYKL075C 1353 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YMR111CYMR111C 1389 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 NOP12YOL041C 1380 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YDR387CYDR387C 1668 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 CBP1YJL209W 1965 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 ADY4YLR227C 1482 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 PSP2YML017W 1782 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 JJJ1YNL227C 1773 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 snR9snR9 187 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 HNT2YDR305C 654 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 HUR1YGL168W 333 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 RRP4YHR069C 1080 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 CBR1YIL043C 855 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YKL131WYKL131W 522 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 ACP1YKL192C 378 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 GAS4YOL132W 1416 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 GLN1YPR035W 1113 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 snR41snR41 95 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 PES4YFR023W 1836 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 IRS4YKR019C 1848 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 ORC6YHR118C 1308 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 MET32YDR253C 576 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YDR415CYDR415C 1125 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YER068C-AYER068C-A 432 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YER087C-AYER087C-A 552 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 TOS8YGL096W 831 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 FYV4YHR059W 393 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YJL175WYJL175W 513 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YJR037WYJR037W 384 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 PAU17YLL025W 375 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 SDO1YLR022C 753 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YMR206WYMR206W 942 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YNG1YOR064C 660 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 RBL2YOR265W 321 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 DSS4YPR017C 432 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 MTC5YDR128W 3447 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YDR131CYDR131C 1671 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 RRP3YHR065C 1506 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 HMRA2YCR096C 360 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 UBC1YDR177W 648 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YER079WYER079W 633 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 COX13YGL191W 390 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YKR032WYKR032W 315 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 SRP40YKR092C 1221 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YML009C-AYML009C-A 327 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ATP11YNL315C 957 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ZPS1YOL154W 750 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 TRS33YOR115C 807 nt5.76□□□□□ -1.49
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