Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt7.78□□□□□ -1.16
MSB4Q12317 VMA21YGR105W 234 nt7.78□□□□□ -1.16
MSB4Q12317 YGR160WYGR160W 612 nt7.78□□□□□ -1.16
MSB4Q12317 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt7.78□□□□□ -1.16
MSB4Q12317 REC104YHR157W 549 nt7.78□□□□□ -1.16
MSB4Q12317 MEU1YLR017W 1014 nt7.78□□□□□ -1.16
MSB4Q12317 IMP2YMR035W 534 nt7.78□□□□□ -1.16
MSB4Q12317 ICL1YER065C 1674 nt7.78□□□□□ -1.16
MSB4Q12317 PAC2YER007W 1557 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 PUG1YER185W 912 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 PRP18YGR006W 756 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 MDE1YJR024C 735 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 GIM3YNL153C 390 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 ECM31YBR176W 939 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 MED1YPR070W 1701 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 CCT3YJL014W 1605 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 MAD3YJL013C 1548 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 PHO5YBR093C 1404 nt7.77□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 PGS1YCL004W 1566 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 CLB2YPR119W 1476 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 snR65snR65 100 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RSM10YDR041W 612 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 MRPL1YDR116C 858 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 BUD13YGL174W 801 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 MTR3YGR158C 753 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YHL037CYHL037C 402 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 BLI1YKL061W 342 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RRT16YNL105W 429 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 ATG8YBL078C 354 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RIB4YOL143C 510 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 CEM1YER061C 1329 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YRB30YGL164C 1323 nt7.76□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RRP3YHR065C 1506 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YET3YDL072C 612 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RRP46YGR095C 672 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 SOP4YJL192C 705 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 AHP1YLR109W 531 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 POR1YNL055C 852 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YBL094CYBL094C 333 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 snR41snR41 95 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RTT109YLL002W 1311 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YEN1YER041W 2280 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 CIR2YOR356W 1896 nt7.75□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YFL040WYFL040W 1623 nt7.74□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 FAU1YER183C 636 nt7.74□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 GTR2YGR163W 1026 nt7.74□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 CGI121YML036W 546 nt7.74□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YBL077WYBL077W 432 nt7.74□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YPL088WYPL088W 1029 nt7.74□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 EDC3YEL015W 1656 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 MRPL28YDR462W 444 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YER034WYER034W 558 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YER134CYER134C 537 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YER158W-AYER158W-A 216 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 HIT1YJR055W 495 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 KTR2YKR061W 1278 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YPT7YML001W 627 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 ALG6YOR002W 1635 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 ZRC1YMR243C 1329 nt7.73□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 ISN1YOR155C 1353 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 UTP4YDR324C 2331 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 HMO1YDR174W 741 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 VMA8YEL051W 771 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 CFD1YIL003W 882 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RPE1YJL121C 717 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 SSP120YLR250W 705 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RPS3YNL178W 723 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 DFR1YOR236W 636 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 RPA43YOR340C 981 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 HST2YPL015C 1074 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 TRM1YDR120C 1713 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 TCM62YBR044C 1719 nt7.72□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YIG1YPL201C 1386 nt7.71□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 YHR202WYHR202W 1809 nt7.71□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 TAH11YJR046W 1815 nt7.71□□□□□ -1.17
MSB4Q12317 GYP8YFL027C 1494 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
MSB4Q12317 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.71□□□□□ -1.18
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