Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 HUR1YGL168W 333 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 ICS3YJL077C 396 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 YJL169WYJL169W 369 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 FUN19YAL034C 1242 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 YKL102CYKL102C 306 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 SRP40YKR092C 1221 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 TOM22YNL131W 459 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 CUZ1YNL155W 825 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 BMT2YBR141C 1014 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 SLF1YDR515W 1344 nt6.9□□□□□ -1.3
YRR1Q12172 FET3YMR058W 1911 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 PPS1YBR276C 2424 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 RPL16AYIL133C 600 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 NTG1YAL015C 1200 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 GEP5YLR091W 882 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YLR171WYLR171W 390 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YBL010CYBL010C 843 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 TAF9YMR236W 474 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YNR014WYNR014W 639 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YPL088WYPL088W 1029 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 RNT1YMR239C 1416 nt6.89□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YCR061WYCR061W 1896 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 THI20YOL055C 1656 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 NOG2YNR053C 1461 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 SRF1YDL133W 1314 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 SPT2YER161C 1002 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YPT7YML001W 627 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YNL092WYNL092W 1203 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 MRPS18YNL306W 654 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 SEC23YPR181C 2307 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 PPM2YOL141W 2088 nt6.88□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 MKK1YOR231W 1527 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 ACA1YER045C 1470 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 GAS4YOL132W 1416 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YMR111CYMR111C 1389 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 STT3YGL022W 2157 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 RPN11YFR004W 921 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 TSA1YML028W 591 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YOL159CYOL159C 516 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 DSS4YPR017C 432 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 TBF1YPL128C 1689 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 SEC18YBR080C 2277 nt6.87□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YDR391CYDR391C 699 nt6.86□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YPT35YHR105W 645 nt6.86□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 RPA49YNL248C 1248 nt6.86□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 ILV6YCL009C 930 nt6.86□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 KNS1YLL019C 2214 nt6.86□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 SNU56YDR240C 1479 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 ISN1YOR155C 1353 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 KIN1YDR122W 3195 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YCL075WYCL075W 441 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 RXT3YDL076C 885 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YDR445CYDR445C 408 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 IZH1YDR492W 951 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 GCG1YER163C 699 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 PUG1YER185W 912 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 MAM33YIL070C 801 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 SQT1YIR012W 1296 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 IES3YLR052W 753 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YLR125WYLR125W 411 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YLR463CYLR463C 552 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 SYC1YOR179C 567 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 UBP9YER098W 2265 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 JIP5YPR169W 1479 nt6.85□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 ARP3YJR065C 1350 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 COX10YPL172C 1389 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 EMP46YLR080W 1335 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 CHK1YBR274W 1584 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 CAD1YDR423C 1230 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YLR297WYLR297W 390 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 OPY1YBR129C 987 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 ARL1YBR164C 552 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 JJJ1YNL227C 1773 nt6.84□□□□□ -1.31
YRR1Q12172 YHK8YHR048W 1545 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 RRP3YHR065C 1506 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 YGR039WYGR039W 312 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 YHR130CYHR130C 336 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 YLR317WYLR317W 435 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 ARC18YLR370C 537 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 FPR3YML074C 1236 nt6.83□□□□□ -1.32
YRR1Q12172 ICY2YPL250C 411 nt6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.6 ms