Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFFO1Q0D2I5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms