Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSC1Q08554 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms