Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYP4F3Q08477 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F3Q08477 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms