Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXL1Q08397 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms