Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms