Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EGR3Q06889 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EGR3Q06889 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms