Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 YNL057WYNL057W 333 nt3.41□□□□□ -1.86
NEJ1Q06148 IDH2YOR136W 1110 nt3.41□□□□□ -1.86
NEJ1Q06148 TIP41YPR040W 1071 nt3.41□□□□□ -1.86
NEJ1Q06148 HEF3YNL014W 3135 nt3.41□□□□□ -1.86
NEJ1Q06148 RTT109YLL002W 1311 nt3.41□□□□□ -1.86
NEJ1Q06148 GEM1YAL048C 1989 nt3.4□□□□□ -1.86
NEJ1Q06148 YDL228CYDL228C 642 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 FCF1YDR339C 570 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RPS4BYHR203C 786 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 TED1YIL039W 1422 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YIL163CYIL163C 354 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 CDC8YJR057W 651 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 SOD1YJR104C 465 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RPS4AYJR145C 786 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 SPC42YKL042W 1092 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 IRC25YLR021W 540 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RIM11YMR139W 1113 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YOR289WYOR289W 756 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 SNF8YPL002C 702 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YPL014WYPL014W 1146 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.4□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 UBX5YDR330W 1503 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YPS7YDR349C 1791 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 AIM7YDR063W 450 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 AHA1YDR214W 1053 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 GRE3YHR104W 984 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 CDC45YLR103C 1953 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YDR132CYDR132C 1488 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 AIM21YIR003W 2040 nt3.39□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 ALO1YML086C 1581 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 TFA1YKL028W 1449 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 UBC1YDR177W 648 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 PCL6YER059W 1263 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RPS9BYBR189W 588 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 PPQ1YPL179W 1650 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YIL092WYIL092W 1902 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 FRT2YAL028W 1587 nt3.38□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 MAL13YGR288W 1422 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 TIP20YGL145W 2106 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 KIN4YOR233W 2403 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 FAP7YDL166C 594 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 DAS2YDR020C 699 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YAE1YJR067C 426 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 UIP3YAR027W 708 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YBL029WYBL029W 1131 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 MDN1YLR106C 14733 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 APP1YNL094W 1764 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 SMC3YJL074C 3693 nt3.37□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 SIR2YDL042C 1689 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YDL183CYDL183C 963 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YFL065CYFL065C 309 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YFR045WYFR045W 930 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YPL088WYPL088W 1029 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 CTR1YPR124W 1221 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RDS1YCR106W 2499 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 PMT6YGR199W 2280 nt3.36□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 MSD1YPL104W 1977 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RPS8BYER102W 603 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RPS0BYLR048W 759 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 COS3YML132W 1140 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RPS8AYBL072C 603 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 MVD1YNR043W 1191 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RPL18AYOL120C 561 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 COS2YBR302C 1140 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YOL019WYOL019W 1656 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 SSU1YPL092W 1377 nt3.35□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 NSP1YJL041W 2472 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 MAF1YDR005C 1188 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 MRPL25YGR076C 474 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YGR079WYGR079W 1113 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 LNP1YHR192W 837 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YIL152WYIL152W 708 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YJR037WYJR037W 384 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YLR036CYLR036C 612 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 IBD2YNL164C 1056 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 RRP36YOR287C 903 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 YPL073CYPL073C 486 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 ECM8YBR076W 1065 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 DER1YBR201W 636 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 POF1YCL047C 777 nt3.34□□□□□ -1.87
NEJ1Q06148 PEX1YKL197C 3132 nt3.34□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 RNT1YMR239C 1416 nt3.34□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 STB3YDR169C 1542 nt3.34□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 NGL3YML118W 1518 nt3.34□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 ZDS2YML109W 2829 nt3.34□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 YBR138CYBR138C 1575 nt3.34□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 YJR030CYJR030C 2238 nt3.34□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 GZF3YJL110C 1656 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 POL1YNL102W 4407 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 SYT1YPR095C 3681 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 INO2YDR123C 915 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 YGR126WYGR126W 693 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 GLO4YOR040W 858 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 YOR338WYOR338W 1092 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 BCH2YKR027W 2298 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 RRN6YBL014C 2685 nt3.33□□□□□ -1.88
NEJ1Q06148 KAP95YLR347C 2586 nt3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms