Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALD1Q05682 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALD1Q05682 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms