Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN1Q05586 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms