Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3AQ05086 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms