Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBE1Q04446 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBE1Q04446 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBE1Q04446 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBE1Q04446 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBE1Q04446 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBE1Q04446 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBE1Q04446 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBE1Q04446 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBE1Q04446 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBE1Q04446 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms