Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2BQ02880 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
TOP2BQ02880 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms