Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms