Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCCQ00597 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms