Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK17Q00537 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms