Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK3Q00526 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK3Q00526 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms