Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms