Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms