Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS9P82933 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS9P82933 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms