Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms