Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2LP62875 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms