Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC6P62333 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC6P62333 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms