Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1S1P61966 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms