Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3BP55884 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms