Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OXCT1P55809 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms