Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL23P55773 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL23P55773 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL23P55773 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL23P55773 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL23P55773 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCL23P55773 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCL23P55773 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCL23P55773 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCL23P55773 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL23P55773 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL23P55773 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL23P55773 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL23P55773 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL23P55773 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL23P55773 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL23P55773 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL23P55773 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL23P55773 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL23P55773 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms