Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFDNP55196 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFDNP55196 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AFDNP55196 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AFDNP55196 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AFDNP55196 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AFDNP55196 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AFDNP55196 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFDNP55196 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFDNP55196 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFDNP55196 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFDNP55196 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFDNP55196 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFDNP55196 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFDNP55196 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AFDNP55196 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFDNP55196 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFDNP55196 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFDNP55196 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFDNP55196 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFDNP55196 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFDNP55196 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFDNP55196 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFDNP55196 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms