Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP3P54108 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms