Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACLYP53396 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACLYP53396 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACLYP53396 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACLYP53396 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACLYP53396 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACLYP53396 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACLYP53396 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACLYP53396 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACLYP53396 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACLYP53396 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACLYP53396 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACLYP53396 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACLYP53396 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACLYP53396 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACLYP53396 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACLYP53396 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACLYP53396 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACLYP53396 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACLYP53396 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms