Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LBX1P52954 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBX1P52954 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBX1P52954 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBX1P52954 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBX1P52954 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBX1P52954 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBX1P52954 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LBX1P52954 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LBX1P52954 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LBX1P52954 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LBX1P52954 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LBX1P52954 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LBX1P52954 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LBX1P52954 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX1P52954 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX1P52954 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX1P52954 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX1P52954 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX1P52954 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX1P52954 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX1P52954 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX1P52954 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX1P52954 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX1P52954 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX1P52954 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX1P52954 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX1P52954 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX1P52954 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX1P52954 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX1P52954 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX1P52954 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX1P52954 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX1P52954 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX1P52954 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX1P52954 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX1P52954 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX1P52954 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX1P52954 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX1P52954 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX1P52954 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX1P52954 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX1P52954 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX1P52954 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms