Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB28P51157 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB28P51157 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB28P51157 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB28P51157 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB28P51157 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB28P51157 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB28P51157 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB28P51157 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB28P51157 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms