Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP153P49790 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP153P49790 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP153P49790 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP153P49790 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP153P49790 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP153P49790 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP153P49790 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP153P49790 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP153P49790 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP153P49790 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP153P49790 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP153P49790 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP153P49790 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUP153P49790 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NUP153P49790 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUP153P49790 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP153P49790 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP153P49790 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUP153P49790 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUP153P49790 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUP153P49790 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUP153P49790 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NUP153P49790 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NUP153P49790 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUP153P49790 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUP153P49790 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
NUP153P49790 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUP153P49790 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUP153P49790 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUP153P49790 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUP153P49790 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUP153P49790 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
NUP153P49790 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUP153P49790 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUP153P49790 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP153P49790 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP153P49790 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP153P49790 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP153P49790 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP153P49790 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUP153P49790 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP153P49790 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP153P49790 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP153P49790 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP153P49790 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUP153P49790 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NUP153P49790 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NUP153P49790 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUP153P49790 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUP153P49790 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NUP153P49790 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUP153P49790 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUP153P49790 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP153P49790 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP153P49790 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP153P49790 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP153P49790 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP153P49790 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUP153P49790 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUP153P49790 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP153P49790 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP153P49790 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP153P49790 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUP153P49790 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUP153P49790 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms