Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPFP49454 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPFP49454 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPFP49454 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPFP49454 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPFP49454 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPFP49454 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPFP49454 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPFP49454 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPFP49454 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPFP49454 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPFP49454 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPFP49454 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPFP49454 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPFP49454 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPFP49454 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPFP49454 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPFP49454 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPFP49454 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPFP49454 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPFP49454 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPFP49454 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPFP49454 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPFP49454 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPFP49454 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPFP49454 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPFP49454 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPFP49454 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPFP49454 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPFP49454 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms