Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms