Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX1P48742 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX1P48742 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX1P48742 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX1P48742 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX1P48742 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX1P48742 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX1P48742 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX1P48742 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX1P48742 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX1P48742 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX1P48742 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX1P48742 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX1P48742 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX1P48742 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX1P48742 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX1P48742 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX1P48742 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX1P48742 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX1P48742 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX1P48742 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX1P48742 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX1P48742 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX1P48742 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms