Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLCP48506 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLCP48506 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCLCP48506 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCLCP48506 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCLCP48506 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLCP48506 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLCP48506 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLCP48506 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLCP48506 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLCP48506 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLCP48506 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLCP48506 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLCP48506 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLCP48506 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLCP48506 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLCP48506 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLCP48506 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLCP48506 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLCP48506 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLCP48506 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLCP48506 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLCP48506 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLCP48506 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms