Protein–RNA interactions for Protein: P47082

AVT1, Vacuolar amino acid transporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT1P47082 FYV12YOR183W 390 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT1P47082 FEX1YOR390W 1128 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT1P47082 LEE1YPL054W 906 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT1P47082 MEI5YPL121C 669 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT1P47082 FEX2YPL279C 1128 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT1P47082 DAK1YML070W 1755 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT1P47082 UBX3YDL091C 1368 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT1P47082 BPL1YDL141W 2073 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 TFA1YKL028W 1449 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 SLM5YCR024C 1479 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 PCL8YPL219W 1479 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 AGE2YIL044C 897 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 RFC2YJR068W 1062 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 APN1YKL114C 1104 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 YKR041WYKR041W 753 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 FLD1YLR404W 858 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 PRM6YML047C 1059 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 PPT2YPL148C 522 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 MET17YLR303W 1335 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 ACC1YNR016C 6702 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 SPT14YPL175W 1359 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT1P47082 YEL077CYEL077C 3834 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 YDL050CYDL050C 372 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 NUP42YDR192C 1293 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 SRB7YDR308C 423 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 RTT105YER104W 627 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 ARO2YGL148W 1131 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 FYV4YHR059W 393 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 NSG1YHR133C 876 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 GLG2YJL137C 1143 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 YJL147CYJL147C 1149 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 MTD1YKR080W 963 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 RPC19YNL113W 429 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 snR11snR11 258 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 DGA1YOR245C 1257 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT1P47082 COT1YOR316C 1320 nt5.4□□□□□ -1.55
AVT1P47082 CDC16YKL022C 2523 nt5.4□□□□□ -1.55
AVT1P47082 SGV1YPR161C 1974 nt5.4□□□□□ -1.55
AVT1P47082 CTS1YLR286C 1689 nt5.4□□□□□ -1.55
AVT1P47082 HXT4YHR092C 1731 nt5.4□□□□□ -1.55
AVT1P47082 SER33YIL074C 1410 nt5.4□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YMR018WYMR018W 1545 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 DRS1YLL008W 2259 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 PDI1YCL043C 1569 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 TRM8YDL201W 861 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 RPL24AYGL031C 468 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YGL262WYGL262W 528 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 RTA1YGR213C 954 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 TPM2YIL138C 486 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 TYE7YOR344C 876 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 PDC1YLR044C 1692 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 RNT1YMR239C 1416 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 RIM101YHL027W 1878 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT1P47082 NGR1YBR212W 2019 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YDL186WYDL186W 834 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 MSW1YDR268W 1140 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 VPS74YDR372C 1038 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 AGA2YGL032C 264 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YKR011CYKR011C 1062 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 SCW10YMR305C 1170 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 SIW14YNL032W 846 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 PEX15YOL044W 1152 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 ISU2YOR226C 471 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 KTR6YPL053C 1341 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 MSS116YDR194C 1995 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 GUS1YGL245W 2127 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 ALT2YDR111C 1524 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT1P47082 HXT17YNR072W 1695 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 IME4YGL192W 1803 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 CAB4YGR277C 918 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 SPL2YHR136C 447 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 FMP33YJL161W 543 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 FUN19YAL034C 1242 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 ATG34YOL083W 1239 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 TRS33YOR115C 807 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 TOA1YOR194C 861 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 RCN2YOR220W 798 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 RFC5YBR087W 1065 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT1P47082 FUI1YBL042C 1920 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 snR7-LsnR7-L 214 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 MMF1YIL051C 438 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 LOH1YJL038C 660 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YKL223WYKL223W 333 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 PBA1YLR199C 831 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 MGR2YPL098C 342 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 snR44snR44 211 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 ENT1YDL161W 1365 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YFR006WYFR006W 1608 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT1P47082 SET4YJL105W 1683 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT1P47082 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT1P47082 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT1P47082 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT1P47082 YDR056CYDR056C 618 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT1P47082 VFA1YER128W 612 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms