Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA1P43355 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MAGEA1P43355 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA1P43355 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms