Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPOP42166 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPOP42166 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPOP42166 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPOP42166 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPOP42166 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMPOP42166 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMPOP42166 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMPOP42166 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMPOP42166 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMPOP42166 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMPOP42166 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMPOP42166 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMPOP42166 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMPOP42166 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMPOP42166 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMPOP42166 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMPOP42166 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMPOP42166 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMPOP42166 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMPOP42166 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPOP42166 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPOP42166 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPOP42166 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPOP42166 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPOP42166 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPOP42166 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPOP42166 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMPOP42166 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMPOP42166 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMPOP42166 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMPOP42166 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMPOP42166 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMPOP42166 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMPOP42166 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMPOP42166 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMPOP42166 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMPOP42166 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMPOP42166 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMPOP42166 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMPOP42166 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMPOP42166 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMPOP42166 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMPOP42166 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMPOP42166 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMPOP42166 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMPOP42166 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMPOP42166 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms