Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms